丽江市分属两个流域、三个水系。长江流域金沙江水系控制本市面积的80.4%，长江流域雅砻江水系控制17.6%，澜沧江流域澜沧江水系控制2.0%。全市大小河流共计91条（按1/100万水系图），其中流域面积在500平方千米或年径流量在2亿立方米以上的河流有10条。全市主要天然湖泊有泸沽湖、程海、拉市海3个，总蓄水量41亿立方米。

2024年，市控以上地表水水质年均值超Ⅲ类标准的三个断面为：漾弓江龙兴村、仙人河永胜城南、漾弓江中岗村。影响超标断面水质的主要因子为溶解氧、氨氮、总磷、化学需氧量、五日生化需氧量。受污染河流的主要污染源为城市生活污水及农村面源污染。

在《云南省水功能区划（2014年修订）》中，泸沽湖水环境功能区划为Ⅰ类。2024年，泸沽湖水质全年稳定在Ⅰ类，水质状况优；程海湖水质全年均值达Ⅳ类（氟化物不参与评价），主要超标因子为化学需氧量；拉市海水质全年均值达Ⅲ类标准，水质状况良好。按湖泊富营养化指标评价，泸沽湖为贫营养性湖泊，程海为中营养性湖泊，拉市海为中营养性湖泊。与上年相比，泸沽湖、程海、拉市海水质状况均无明显变化。泸沽湖、程海湖、拉市海营养状态指数相关监测项目及结果见表2。

丽江市中心城区道路交通昼间噪声平均等效声级值为61.2分贝，与上年相比，降低了0.3分贝，城市道路声环境质量为好。

玉龙县道路交通昼间噪声平均等效声级值为60.1分贝，与上年相比，降低了1.4分贝，城市道路声环境质量为好；永胜县道路交通昼间噪声平均等效声级值为51.9分贝，与上年相比，增加了3.6分贝，城市道路声环境质量为好；华坪县道路交通昼间噪声平均等效声级值为60.9分贝，与上年相比，增加了0.9分贝，城市道路声环境质量为好；宁蒗县道路交通昼间噪声平均等效声级值为64.6分贝，与上年相比，增加了3.0分贝，城市道路声环境质量为好。

丽江市中心城区昼间平均等效声级值为50.9分贝，城市区域声环境质量为较好；玉龙县昼间平均等效声级值为50.2分贝，城市区域声环境质量为较好；永胜县昼间平均等效声级值为48.9分贝，城市区域声环境质量为好；华坪县昼间平均等效声级值为53.9分贝，城市区域声环境质量为较好；宁蒗县昼间平均等效声级值为51.2分贝，城市区域声环境质量为较好。2024年丽江市中心城区区域环境噪声昼间分布情况见图1。

2024年，丽江市中心城区及4个县城市功能区环境噪声昼间平均等效声级值除古城十字路口点位外均达标；夜间除古城十字路口、红太阳广场点位外均达标。

1类区古城十字路监测点的昼、夜平均等效声级值超《声环境质量标准》（GB3096-2008）1类标准限值。昼间小时等效声级超标率为46.9%，夜间小时等效声级超标率为43.8%。

2类区红太阳广场监测点的昼间平均等效声级值达2类标准，夜间平均等效声级值超2类标准限值。昼间小时等效声级超标率为14.1%，夜间小时等效声级超标率为50.0%。

2024年，玉龙县、永胜县、华坪县、宁蒗县城市功能区噪声昼、夜平均等效声级值均达《声环境质量标准》（GB3096-2008）限值。

丽江市地处滇西北横断山区，属于金沙江中上游地区，是“三江并流”世界自然遗产地的重要组成部分。该地区地质特殊、地形复杂、气候多样，拥有丰富的生物资源、矿产资源、水能资源等自然资源，市域内有拉市海高原湿地自然保护区、玉龙雪山自然保护区、泸沽湖自然保护区、老君山国家公园保护区等。随着丽江市工业高速发展，重金属、危险化学品、持久性有机污染物、危险废物等对土壤污染的风险因素加大，对丽江市土壤环境保护和治理的任务更加艰巨。

受地质、地貌、气候、植被、人类活动等多种因素的影响，形成多种类型的土壤。据全市第二次土壤普查，市内共有16个土类，28个亚类，72个土属，168个土种。

位于丽江市的南面和东面的永胜、华坪，以红壤系列为主；而北面的宁蒗县和西北的玉龙县，又以棕壤系列的土壤为主。

2024年，丽江市辐射环境监测数据显示，全年γ辐射空气吸收剂量率平均值为126.8nGy/h，处于自然本底波动范围内，表明环境中的辐射水平安全稳定。气溶胶、沉降物中的天然放射性核素如7Be、210Pb、40K的活度浓度均在背景水平范围内，空气中131I未检出，显示无异常放射性污染事件发生。重点湖库水体和城市集中饮用水源地的放射性核素浓度远低于国家规定的限值，水体安全性得到保障。土壤中放射性核素含量符合自然背景水平，没有人为增加的迹象。所监测的点位电磁辐射环境水平均远低于公众曝露控制限值。